Здравствуйте, Мария.
Считаю, что в данном случае не усматривается состава правонарушения, предусмотренного статьей 19.7.13. КоАП РФ «Непредставление или несвоевременное представление в таможенный орган статистической формы учета перемещения товаров».
Вопросы привлечения к ответственности рассматриваются в Письме ФТС России от 01.02.2017 N 18-19/04746 «О направлении методических рекомендаций» (вместе с «Методическими рекомендациями по квалификации и расследованию административных правонарушений, предусмотренных статьей 19.7.13 Кодекса Российской Федерации об административных правонарушениях»).
В частности, дается разъяснение, что:
Статформа заполняется с использованием программного обеспечения, размещенного на официальном сайте ФТС России, и представляется в электронном виде или на бумажном носителе за отчетный месяц, в котором осуществлялась отгрузка или получение товаров, по нескольким отгрузкам (получениям) товаров, отгруженных (полученных) на одних и тех же условиях в рамках одного контракта (договора) (при наличии), или отдельно по каждой отгрузке (получению) товаров.Датой представления статформы в электронном виде считается дата ее отправки посредством сети Интернет, а на бумажном носителе — дата отправки по почте заказным письмом, указанная на почтовом штемпеле, либо дата фактической передачи в таможенный орган, то есть дата регистрации в таможенном органе в соответствии с установленными правилами делопроизводства.
Таким образом, считаю, что сотрудники почему то приняли во внимание только почтовое отправление, которое отправлено с нарушением сроков, и проигнорировали стат форму, отправленную посредством сети интернет в установленные законом сроки.