Почему продавать незаконный товар магазин может, а покупать по заявлению таможенников его нельзя?

Магазин не в состоянии поддерживать формуляр на 200 стран. То есть для этих стран можно, а для этих нет. Потому нужно самому знать, что покупаешь.
Грозит привлечение к уголовной ответственности за приобретение шпионского оборудования по ст. 138.1 УК РФ, то что вы добровольно заблуждались будет учтено, но и при этом придётся 100500 выслушать аксиому: не знание закона — не освобождает от ответственности.
Вот пример из прессы

Здравствуйте, Сергей,  скорее всего такие ручки продают с иностранных интернет — магазинов, а как вы  понимаете, это уже другое законодательство

.Что сейчас мне могут предьявить.

Сергей

возможна  уголовная ответственность. 

«Уголовный кодекс Российской Федерации» от 13.06.1996 N 63-ФЗ (ред. от 19.02.2018)

Статья 138.1. Незаконный оборот специальных технических средств, предназначенных для негласного получения информации

(введена Федеральным законом от 07.12.2011 N 420-ФЗ)

Незаконные производство, приобретение и (или) сбыт специальных технических средств, предназначенных для негласного получения информации, — наказываются штрафом в размере до двухсот тысяч рублей или в размере заработной платы или иного дохода осужденного за период до восемнадцати месяцев, либо ограничением свободы на срок до четырех лет, либо принудительными работами на срок до четырех лет с лишением права занимать определенные должности или заниматься определенной деятельностью на срок до трех лет или без такового, либо лишением свободы на срок до четырех лет с лишением права занимать определенные должности или заниматься определенной деятельностью на срок до трех лет или без такового.