Добрый день!
1. Выбор формы ООО или ИП имеет значение а) для налоговых и бухгалтерских вопросов б) для распределения дивидендов (если есть не 1, а более собственников) в) для развития бизнеса и его устойчивости г) доверия клиентов. Но осуществлять эту деятельность Вы сможете как через ООО, так и через ИП д) процедуре регистрации
Таким образом — выбор за Вами.
2. Вам нужно будет разработать и зарегистрировать товарный знак. Делается это через Роспатент.
3. Также возможно получение патента на саму разработку (если она патентоспособна).
4. Об авторских права: права автора всегда остается за физическим лицом, которое придумало данную разработку. А вот исключительные права (как раз то, за что Вы хотите получать деньги по франшизе) будут у того, кому они будут переданы.
Примеры:
ситуация 1: если Вася разрабатывает приложение, Вася регистрирует ИП, ИП Вася регистрирует товарный знак и от своего имени заключает договоры — вопросов нет. Все права у Васи.
ситуация 2: если Вася разрабатывает приложение, Вася и Петя регистрируют ООО, ООО регистрирует на себя товарный знак, то права на приложения остались у Васи. И с точки зрения права никакого отношения к ООО не имеют. Нужно их юридически передать от Васи в ООО.
5. Вопрос про СНГ: регистрация товарного знака в одной стране не дает ему защиты в другой. Таким образом, лучше давать правовой охрану на все страны, в который предполагаете работать. Но! В силу того, что это не дешево (с точки зрения пошлин) и не быстро надо считать экономику данных действий.
В любом случае юридических вопросов по работе и продвижению бизнеса может возникнуть много.
Главное: пока у Вас (Вас в смысле того экономического субъекта, который будет заниматься бизнесом) нет прав на разработку, то и никакого договора на их передачу быть не может.