Уплата налога по ЕНВД

Здравствуйте, Алексей!

правомерно ли требование налоговой инспекции об уплате налога за 2 транспортных средства, на основании того, что они оба поименованы в вышеназванном списке?

Требование налогового органа правомерно. Налог на ЕНВД рассчитывается исходя из Количества автотранспортных средств, используемых для перевозки грузов. Тот факт, что одно из транспортных средств простаивает или используется вместо первого как запасное, а не одновременно с ним, здесь не имеет значения. 

Статья 346.29. Объект налогообложения и налоговая база
3. Для исчисления суммы единого налога в зависимости от вида предпринимательской деятельности используются следующие физические показатели, характеризующие определенный вид предпринимательской деятельности, и базовая доходность в месяц:
Оказание автотранспортных услуг по перевозке грузов
Количество автотранспортных средств, используемых для перевозки грузов

Либо просто исключайте из всех договоров второе транспортное средство, чтобы нигде не было упоминания о его использовании в предпринимательской деятельности. 

Алексей, добрый день! Согласно ст. 346.29 НК

2. Налоговой базой для исчисления суммы единого налога признается величина вмененного дохода, рассчитываемая как произведение базовой доходности по определенному виду предпринимательской деятельности, исчисленной за налоговый период,и величины физического показателя, характеризующего данный вид деятельности.

в случае с пассажирскими перевозками соответствующим физическим показателем является количество посадочных мест

при этом, согласно ч. 9 той же статьи

9. В случае, если в течение налогового периода у налогоплательщика произошло изменение величины физического показателя, налогоплательщик при исчислении суммы единого налога учитывает указанное изменение с начала того месяца, в котором произошло изменение величины физического показателя.

соответственно поскольку у Вас в договоре на оказание  услуг по перевозке пассажиров  прописано два ТС, для исчисления суммы налога берется количество посадочных мест имеющихся в указанных ТС. Соответственно пока ТС, фактически не участвующее в перевозках не исключат из договора, т.е. не будет изменения физического показателя, используемого для определения налоговой базы

ст. 26 Федерального закона от 13.07.2015 N 220-ФЗ

«Об организации регулярных перевозок пассажиров и багажа автомобильным транспортом и городским наземным электрическим транспортом в Российской Федерации и о внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации»

1. В реестры маршрутов регулярных перевозок должны быть включены следующие сведения:

9) виды транспортных средств и классы транспортных средств, которые используются для перевозок по маршруту регулярных перевозок, максимальное количество транспортных средств каждого класса;