Денис здравствуйте! В данном случае доказать ваши затраты каким либо иным способом, кроме договора купли продажи с отцом не предоставляется возможным. Вы можете при подачи декларации воспользоваться имущественным вычетом на сумму 250000 рублей.
НК РФ Статья 220. Имущественные налоговые вычеты
2. Имущественный налоговый вычет, предусмотренный подпунктом 1 пункта 1 настоящей статьи, предоставляется с учетом следующих особенностей:
1) имущественный налоговый вычет предоставляется:
…
в размере доходов, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи иного имущества (за исключением ценных бумаг), находившегося в собственности налогоплательщика менее трех лет, не превышающем в целом 250 000 рублей;
То есть из дохода, полученного от продажи, 400000 рублей отнимаете имущественный вычет 250 000 рублей и с оставшейся разницы 150000 рублей уплачиваите НДФЛ 13% — 19500 рублей.