Возможность отклонения заявки, если указаны параметры до внесения изменений

Оксана  Добрый день!

Статья 43. (44 ФЗ) Изменение и отзыв заявок

Участник конкурса, участник аукциона, участник запроса котировок, участник запроса предложений вправе изменить или отозвать свою заявку до истечения срока подачи заявок с учетом положений настоящего Федерального закона. В этом случае участник конкурса, участник аукциона не утрачивают право на внесенные в качестве обеспечения заявки денежные средства. Изменение заявки или уведомление о ее отзыве является действительным, если изменение осуществлено или уведомление получено заказчиком до истечения срока подачи заявок.
 
Письмо Министерства экономического развития РФ от 16 декабря 2016 г. N Д28и-3538 «О разъяснениях, связанных с применением Федерального закона от 5 апреля 2013 г. N 44-ФЗ»
Также отмечаем, что изменения в заявку, в соответствии со ст 43 Закона N 44-ФЗ, являются документами, дополняющими уже поданную заявку. Документы, поданные в составе изменений в заявку, являются частью заявки. В связи с этим необходимость подавать повторно полный комплект документов при внесении изменений в заявку в соответствии с требованиями документации о закупке отсутствует.

Да, отклонить могут как несоответствующую требованиям. Вам необходимо отозвать свою заявку, а потом сразу же подать новую заявку с учетом внесенных заказчиком требований. Почему отозвать, потому что  от одной организации две заявки не могут быть. 

оснований для отклонения у заказчика не было. Вы уже дали согласие на выполнение работ на условиях предусмотренных документацией.форма такого согласия законом не предусмотрена, таким образом, сам факт подачи заявки означает что вы согласны выполнить условия контракта.при этом изменять заявку вы должны только в случае если какие тотее данные не соотвествуют тому что указано в документации.в вашем случае это могли быть данные относительно показателей ооваров используемых при выполнении работ.