Как самостоятельно выйти из ООО и сдать полномочия генерального директора?

Владислав, самостоятельно выйти из Общества Вы можете в соответствии с процедурой, установленной ФЗ «Об ООО» ( с учетом ст.26 ФЗ в части не оплаты долей в уставном капитале:

Выход участника общества из общества не освобождает его от обязанности перед обществом по внесению вклада в имущество общества, возникшей до подачи заявления о выходе из общества.

и нотариального заверения такого заявления.
Вопрос прекращения полномочий Ген.директора зависит от условий заключенного Вами трудового договора с ООО и Устава ООО. По общему правилу Вы можете расторгнуть трудовой договор, направив уведомление об увольнении по собственному желанию ( ст.280 Трудового кодекса:

Руководитель организации имеет право досрочно расторгнуть трудовой договор, предупредив об этом работодателя (собственника имущества организации, его представителя) в письменной форме не позднее чем за один месяц.