Здравствуйте
Вам следует учесть, что в соответствии с Постановлением Правительства РФ от 16 июля 2009 г. № 584 ''Об уведомительном порядке начала осуществления отдельных видов предпринимательской деятельности'' при начале указанной предпринимательской деятельности необходимо направить уведомление и ряд документов в соответствующее территориальное подразделение Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзор).
Кроме того Вам необходимо приобрести ККМ и использовать ее во взаиморасчетах с покупателями.
Кроме того, при торговле товарами в интернет-магазине необходимо учитывать Правила продажи товаров дистанционным способом.
В зависимости от вида предлагаемой к продаже продукции, Вам потребуется получение от поставщика обязательного сертификата или декларации о соответствии такой продукции, установленным стандартам.
Что касается медкнижек, то этот вопрос спорный. Посмотрите на ответ, подготовленный по этому поводу специалистами системы Гарант.
www.garant.ru/consult/business/611513/