Как рассчитать налог при продаже машиноместа?

да, машиноместо (находится в многоуровневом паркинге)

Я бы считала не так, с учетом следующего( обратите внимание на пп 2, не могу почему-то выделить — на работает форматирование):

1) имущественный налоговый вычет предоставляется:
в размере доходов, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи иного недвижимого имущества, находившегося в собственности налогоплательщика менее минимального предельного срока владения объектом недвижимого имущества, установленного в соответствии со статьей 217.1 настоящего Кодекса, не превышающем в целом 250 000 рублей;
2) вместо получения имущественного налогового вычета в соответствии с подпунктом 1 настоящего пункта налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением этого имущества.
ст. 220, «Налоговый кодекс Российской Федерации (часть вторая)» от 05.08.2000 N 117-ФЗ (ред. от 03.04.2017) {КонсультантПлюс}

Следовательно, вы вправе уменьшить свои доходы на расходы по приобретению.

Уплатить налог придется с 1400 -1000 = 400 т.р.

Рамиль, спасибо за быстрый ответ. Скажите пожалуйста, а возможно ли уплатить налог за минусом расходов, то есть 1 400 000 минус 1 000 000 = 400 000 х 13% ?

И еще вопрос, покупатель хочет, чтобы я уступил в цене на эти 13% и хочет составить договор купли-продажи ниже 1 млн. рублей а в доп. соглашении прописать еще 400 000. Какие риски недополучения данных средств есть у меня, есть ли такая практика составления таких договоров ?

Я бы считала не так, с учетом следующего( обратите внимание на пп 2, не могу почему-то выделить — на работает форматирование):
Степанова Татьяна

Да, согласен, он может выбрать либо как установленная законодательно сумма,

либо в размере ранее совершенных расходов