Доброго времени суток Екатерина!
Сейчас, в настоящее время всё стало просто намного проще: от ИП необходимо заявление по определенной форме о прекращении деятельности в качестве ИП и оригинал документа подтверждающего уплату гос. пошлины в размере 160 руб. — всё это подается в орган где ИП стоит на учете как ИП. Через 5 рабочих дней, не считая день подачи и день выдачи документов — он или его законный представитель по доверенности получит выписку об исключении его как ИП из реестра. По поводу ПФР и сведений — их отсутствие или не предоставление в срок не является основанием для отказа в прекращении деятельности в качестве ИП. Но, раз уж таковые необходимо было сдать в территориальный ПФР обязательно, (например у ИП были наемные работники), то лучше это сделать поздно, чем никогда.