Как учредителю и ген директору в одном лице выйти из состава ООО?

Дополнение.

В вопросе подготовки протокола необходимо обратиться к уставу общества, но скорее всего в старой редакции устава условий о заверении протокола и принятии решений не будет.

Могу порекомендовать следующий путь.

В соответствии с п. ст. 67.1 ГК РФ:

3. Принятие общим собранием участников хозяйственного общества решения и состав участников общества, присутствовавших при его принятии, подтверждаются в отношении:
3) общества с ограниченной ответственностью путем нотариального удостоверения, если иной способ (подписание протокола всеми участниками или частью участников; с использованием технических средств, позволяющих достоверно установить факт принятия решения; иным способом, не противоречащим закону) не предусмотрен уставом такого общества либо решением общего собрания участников общества, принятым участниками общества единогласно.

Т.е. необходимо подготовить протокол, который будет датирован до 01.09.2014 г. (до вступления в силу изменений ГК) о том как в ООО удостоверяют способ принятия решений. И в протоколе о выборе генерального директора надо будет указать на этот протокол.