Можно ли подать уточненную декларацию и уменьшить сумму ЕНВД, подлежащую уплате?

Добрый день! Пришло уведомление из налоговой с требованием предоставить пояснение: сумма ЕНВД за 3 квартал 2014 года неправомерно уменьшена на сумму неуплаченных в налоговом периоде страховых взносов. Страховые взносы, действительно, были уплачены позже и бухгалтер подала уточненную декларацию после того как эти взносы были уплачены и уменьшила сумму исчисленного налога. Могла ли она так поступать? и что делать в данной ситуации сейчас?

Заранее благодарю за ответ.