Валерий, здравствуйте!
Величина налога на доходы физических лиц определена законодательно — это 13%.
Если право собственности на квартиру возникло до 1 января 2016 года, то налог будет взиматься с суммы, которую Вы укажете в договоре продажи.
Если право собственности возникло уже в этом году, то — либо по сумме в договоре, либо, если она меньше кадастровой стоимости, будет применяться коэффициент 0,7 от кадастровой стоимости.
учитывается ли сумма при покупке этой квартиры?
Да.
Налоговый кодекс, ст.220. Вместо получения имущественного налогового вычета (1 000 000 руб) налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением этого имущества.