В заявлении Вы будете оспаривать законность протокола об отказе в назначении Вам досрочной пенсии. Это предмет спора, т.е. признать незаконным и т.д.
Требование о перерасчете за предыдущие периоды суд оставит без удовлетворения, поскольку вопрос о назначении пенсии ранее 03.11.2015 не ставился на рассмотрение перед комиссией Пенсионного Фонда.
Начисление и выплата пенсии начинается с момента обращения за ней, т.е., для Вас — с 03.11.2015 г.
Обратиться за назначением досрочной пенсии — это Ваше право. Соответственно, Вы реализуете его по своему усмотрению: обращаетесь сразу по факту выработки 25-летнего стажа или позже на 6 месяцев, или, например, не обращаетесь вовсе.