Добрый день, Роман!
1) В п.2.2.2 просто исправлена опечатка, указана ссылка на верный пункт договора.
2) Пункт 2.2.3 соответствует требованиям действующего законодательства.
3) Условия по пункту 3.2 — являются договорными. Риск в том, что оплату производят частями, предоплата только 50%, остальное после приемки груза.
4) Пункт 3.8 соответствует требованиям законодательства
5) Пункт 3.9 в Вашу пользу
6) Пункт 5.2 — условие договорное, ограничение размера неустойки часто указывается. Тут смотрите сами устраивает Вас это или нет. Означает, что неустойку больше чем в размере 10% от задолженности не взыщите.
7) По пункту 5.3 — нормальное уточнение, значит что требовать возмещения можете только реально понесенных убытков, которые должны быть документально подтверждены. Как правило, такие вещи не возмещают добровольно, а когда обратитесь в суд все равно придется документально подтверждать свои убытки
8) Пункт 5.4 никаких дополнительных обязательств на Вас не накладывает. Вы и так в силу Закона несете ответственность за неисполнение обязательтсв.
9) Пункт 7.2 — не противоречит Закону. По общему правилу рассматривается по месту нахождения ответчика, но стороны могут сами определить место рассмотрения спора. Обычно рассуждают так, какова вероятность, что вы будете истцом или ответчиком, если больше что будете истцом, то указывайте по месту нахождения истца, иначе рискуете нести дополнительные представительские и транспортные расходы.
В целом изменения допустимые и не несут особых рисков для Вас.
Удачи!
И для экспедитора, в том числе, увеличения рисков по договору, не наблюдается.