Добрый день!
Первоначально необходимо обратиться в военкомат (в идеале официально, в письменной форме) с целью получения официальных сведений о том, что биологический отец является безвестно отсутствующим. Также сведения о БВП в обязательном порядке имеются в следственном комитете, откуда также могут быть получены путем направления официального запроса.
Кроме того, в военкомате также необходимо получить официально подтвержденную информацию о наличии сведений о ДНК пропавшего, для дальнейшего предоставления в суд.
В дальнейшем необходимо подготовить исковое заявление в суд по месту жительства о признании отцовства (с приложением в качестве доказательств вышеполученных сведений, данных о ребенке).
Дополнительно в качестве 3-его лица в исковом заявлении рекомендую привлечь Военкомат (в случае возникновения у суда необходимости получить иные сведения о пропавшем).
Это наиболее эффективный способ разрешить Ваш вопрос.
При этом, параллельно можно обратиться в прокуратуру города для разъяснения данного вопроса и оказания помощи в его разрешении.