Здравствуйте я военнослужащий по контракту, сейчас диагноз тромбоз глубоких вен обеих нижних конечностей и хронический оклюзирующий тромбоз, возможно ли увольнение со службы?

Да, увольнение с военной службы при диагнозе тромбоз глубоких вен обеих нижних конечностей и хронический окклюзирующий тромбоз не только возможно, но и весьма вероятно, так как данные патологии часто ведут к признанию военнослужащего негодным или ограниченно годным.
 
Категория годности и Расписание болезней
Ваше состояние оценивается по статье 45 Расписания болезней (Приложение к Положению о военно-врачебной экспертизе). 

Категория «Д» (не годен): Присваивается при значительных нарушениях кровообращения и тяжелых формах заболевания (например, если тромбоз привел к выраженной хронической венной недостаточности IV степени с трофическими нарушениями).
Категория «В» (ограниченно годен): Присваивается при умеренных или незначительных нарушениях функций. В обычное время это дает право на увольнение, однако в период мобилизации (СВО) увольнение по категории «В» возможно только для определенных категорий (согласно Указу № 580 или при наличии специфических социально-правовых оснований).

Медицинское освидетельствование: Вам необходимо добиться направления на ВВК (военно-врачебную комиссию). Для этого подайте рапорт на имя командира части о направлении на обследование в связи с ухудшением состояния здоровья, приложив копии имеющихся медицинских заключений.
Прохождение комиссии: ВВК оценит степень нарушения функций конечностей и кровотока. Окклюзирующий (закупоривающий) характер тромбоза является серьезным осложнением, которое существенно ограничивает физическую активность и требует постоянного лечения.
Заключение ВВК: Если комиссия вынесет решение о категории «Д», вы подлежите обязательному увольнению и исключению из списков части. Если будет установлена категория «В», возможность увольнения будет зависеть от текущих директив командования и специфики вашего контракта.