Здравствуйте, был дом на два хозяина у каждого свой участок в собственности, отдельный вход.с другим

Составьте акт осмотра состояния крыши с участием независимых экспертов, фиксируя факт нарушения гидроизоляции и направление стекания воды на вашу территорию.
Потребуйте от соседа добровольно устранить недостаток конструкции крыши, приведя ее в надлежащее техническое состояние.
Если сосед игнорирует ваши требования, подавайте иск в суд о понуждении произвести исправления в конструктивных элементах строения, нарушающих санитарные и технические нормативы.
Кроме того, важно проверить наличие разрешения на строительство и соблюдение градостроительных норм при возведении новой постройки. Если выявлены нарушения, можете дополнительно обращаться в надзорные органы для привлечения соседа к ответственности.

Здравствуйте.
В вашей ситуации очевидно нарушение как градостроительных, так и гражданских норм, а также — нарушение ваших соседских прав. 

1. Факт нарушения
Если сосед построил новый дом и сделал крышу с уклоном в вашу сторону, из-за чего вода стекает к вам под дом, — это нарушение статьи 304 ГК РФ («владелец может требовать устранения нарушений, даже если его не лишают владения»), а также СНиП и норм застройки.

По строительным нормам запрещено:

направлять водостоки и ливневые потоки на соседний участок;
использовать конструкции, которые создают потенциальный ущерб соседу (в вашем случае — подмыв и затопление).
2. Что делать
Шаг 1: Направьте претензию соседу.
Письменно, в свободной форме. Укажите:

что вода с его крыши затапливает ваш участок и подвал,
что он направил сток на вашу сторону,
потребуйте устранить нарушение (например, установить водосточную систему и отвод воды в безопасную зону).
Шаг 2: Обратитесь в администрацию (архитектурный отдел) и в жилищную инспекцию.
Проверьте, была ли у соседа разрешительная документация на строительство, проект и согласование:

мог ли он вообще строить с таким уклоном;
не нарушены ли границы, отступы и пр.
Шаг 3: Проведите фиксацию ущерба.

Сделайте фото и видео того, как вода попадает на ваш участок;
Пригласите независимого эксперта или оценщика, если уже есть повреждения фундамента;
Составьте акт с соседями или ТСЖ/ЖК, если возможно.
Шаг 4: Обратитесь в суд.
Если сосед откажется добровольно устранять нарушение, вы можете подать иск:

об устранении препятствий в пользовании землёй (ст. 304 ГК РФ),
о возмещении ущерба (если есть повреждения),
о признании действий по строительству нарушающими нормы.
3. По поводу «мешковины»
Если он скинул с крыши временное укрытие (мешковину), чтобы вода шла не к нему, а к вам — это также можно квалифицировать как умышленное нарушение ваших прав, и это усиливает вашу позицию.

 
Если нужно — могу помочь составить текст претензии или иска.