Каким образом указ президента может отменять и исключать нормы ФЗ 53?

Валерий!

Полагаю, что в сложившейся сейчас ситуации правоприменительным органам достаточно и такого указания в ст. 1 ФЗ «О воинской обязанности и военной службе» №53-ФЗ от 28.03.98:

2. В период мобилизации, в период военного положения и в военное время воинская обязанность граждан определяется федеральными конституционными законами, федеральными законами, иными нормативными правовыми актами Российской Федерации 

Если Вам необходима дополнительная консультация либо помощь в составлении письменных документов, можете обратиться в мой чат, по правилам сайта услуги в чате платные.