Здравствуйте! Если у него сейчас квартира по договору найма специализированных жилых помещений, и договор на 5 лет, то да, есть риск, в том, что ему не предоставят в последующем эту квартиру по договору социального найма.
Так как он не будет соответствовать критериям, указанным в ч. 1 ст. 8 Федерального закона «О дополнительных гарантиях по социальной поддержке детей-сирот и детей, оставшихся без попечения родителей» от 21.12.1996 N 159-ФЗ.
В браке Вы приобретаете собственность, она совместная в этом случае, если Вы возьмете ипотеку, поэтому да, есть риск незаключения в дальнейшем договора социального найма в отношении этой квартиры.