Здравствуйте!
Согласно ст. 298 Трудового кодекса РФ к работам, выполняемым вахтовым методом не могут привлекаться работники имеющие противопоказания к выполнению работ вахтовым методом в соответствии с медицинским заключением, выданным в порядке, установленном федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации.
Противопоказания к выполнению работ устанавливаются Приказом Минздрава России от 28.01.2021 N 29н(Приложение 2).
Подробнее здесь-https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_375353/
Категория годности «Д» может быть присвоена лицу по результатам военно-врачебной комиссии в соответствии с положениями Постановления Правительства РФ N 565 «Об утверждении Положения о военно-врачебной экспертизе» .
Подробнее здесь-https://www.consultant.ru/document/cons_doc_LAW_149096/
В данном случае возможно, что лицо, допущенное к работе на опасном производственном объекте, имеет заболевание, которое не учитывается Приказом Минздрава, но служит основанием для признания негодным к военной службе(однако, учитывая, что речь об опасном производственном объекте, то более вероятным представляется возможность улучшения состояния здоровья, ненадлежащее медицинское освидетельствование или другие факторы). Во всяком случае без наличия медицинской документации пока можно делать только предположения.