Уважаемая Ирина Николаевна!
Просто так к ответственности не привлекают, если не будет заявления пострадавшей стороны (исключение составляют некоторые особые категории дел (публичного характера), но к Вашему случаю они не имеют отношения). Поэтому пока организация не обратится в органы внутренних дел с соответствующим заявлением, никому не будет интересно кого-то к чему-то привлекать.
Но к слову сказать, такие методы «отбивания своего» всё-таки не совсем законны. Начать с того, что Ваша племянница, идя на неофициальное трудоустройство, мало того, что должна была понимать, на какие риски, связанные с этим, идёт, так сама же ещё такими действиями нарушила закон, ибо, чего греха таить, как правило, неофициальное оформление производится с целью неуплаты налогов как работодателем, так и сотрудником. И поэтому в данном случае факт того, что организация должна ей выплатить какие-то деньги ничем не подтверждается, а вот то, что Ваша племянница, подчеркиваем, незаконно удерживает чужое имущество и подтверждать не надо — она сама об этом сообщила. Так что организации, в случае чего, и доказывать ничего не придется.
Поэтому наш Вам совет убедить племянницу договориться полюбовно с руководителем. Практически не существует человека, с которым нельзя было бы договориться, если правильно подготовиться к этому разговору, подобрать слова, привести аргументы и факты. Наверняка, когда она поступала на работу существовали определённые договоренности того, как организация будет рассчитываться с ней. В противном случае можно будет попробовать через суд вернуть свои деньги, собрав доказательства того, что она фактически осуществляла трудовую деятельность в данной организации (справки, какие-то личные отчеты, показания свидетелей-коллег и т.п.).
Удачи Вам!