Если купили квартиру с использованием материнского капитала или другой субсидии, при расчете налогового вычета должны считать стоимость квартиры без учета субсидии. Основание: п. 5 ст. 220 НК РФ.
Государственные субсидии, включая материнский капитал, военные сертификаты, деньги работодателя и прочее не являются личными и не могут участвовать при расчете налогового вычета. Следовательно, на них нельзя получить вычет.
Если купили квартиру с использованием материнского капитала или другой субсидии, при расчете налогового вычета должны считать стоимость квартиры без учета субсидии. Основание: п. 5 ст. 220 НК РФ.
Согласно ст. 81 п. 1 налогоплательщик обязан уведомлять ФНС об ошибках в декларации, которые привели к уменьшению налога. Для этого надо подать уточнённую декларацию.
Сроки подачи в НК РФ не прописаны. Однако если налоговая найдёт переплату по вычету раньше, то выставит требование по возврату.
Таким образом вы имеете право получить вычет, от суммы, а минусом материнского капитала. Сейчас получается, что налоговая по вычету сделала Вам переплату, которую придется вернуть. Если бы Вы использовали материнский капитал для других целей, то часть вычета не пришлось бы возвращать. Часть полученного налогового вычета придется вернуть. Налоговая должна прислать Вам письмо о переплате, либо можете сами обратиться в налоговую для ускорения процесса. В любом случаи возвращать деньги придется.