Здравствуйте.
Если продление срока подписания было обоснованным, то последствий быть не должно.
Неблагоприятных вариантов развития может быть несколько.
Обращение третьего лица в прокуратуру или иные контрольные органы с требованием привлечь заказчика к ответственности за нарушение требований закона и незаконном продлении срока. Данное обращение может также содержать требование о признании контракта недействительным, т.к. он заключен с нарушением закона.
Вероятность внесения в РНП зависит от результатов рассмотрения такого обращения.
Для более содержательного ответа, нужно более детально изучить вашу ситуацию.
В случае если Вам необходима профессиональная юридическая помощь по данному вопросу, обратитесь ко мне в чат, я постараюсь Вам помочь.