Добрый вечер!
В этой системе взаимодействия получается, что налог с доходов водителя не платит никто. «Яндекс.Такси» платит налоги со своей комиссии, Партнёр-Агент платит налоги со своей комиссии, водители получают деньги от Партнёров-Агентов и не платят налог. Получается, что сами водители работают вне рамок правового поля.
По закону если водитель такси не является самозанятым, то налоговым агентом по НДФЛ за него выступает Партнер-Агент по агентскому договору.
В статье 226 Налогового кодекса указано: компании (ООО или ИП), от которых или в результате отношений с которыми налогоплательщик получил доход, являются налоговыми агентами и обязаны удержать и перечислить налог на доходы физических лиц.
В договоре между Партнёром-Агентом и водителем, как правило, есть указание на то, что водитель является выгодоприобретателем и оказывает услуги по перевозке от своего имени, а значит и налоги должен платить самостоятельно. Однако с точки зрения законодательства данный пункт можно признать ничтожным.
В вашем случае, если вы хотите «выйти из тени» то вы самостоятельно до 30.04 года следующего за отчетным исчисляете налог 13% от вашего дохода и сдаете в налоговую декларацию 3-НДФЛ. Всего удобнее это сделать через личный кабинет налогоплательщика.
При уплате НДФЛ расходы на бензин и ремонт не учитываются. Это вправе сделать только ИП на системе налогообложения Доходы-Расходы.