Здравствуйте.
Само по себе казначейство наложить арест на счет не может. Для этого необходим исполнительный документ (исполнительный лист или судебный приказ).
На основании ст.8 Федерального закона «Об исполнительном производстве»
Исполнительный документ о взыскании денежных средств или об их аресте может быть направлен в банк или иную кредитную организацию непосредственно взыскателем.
то есть минуя судебного пристава-исполнителя. Это — в том случае, если состоялось решение суда.
Если же к Вам только предъявили иск — то истец (казначейство и т.п.) одновременно с предъявлением иска могли подать суду заявление о принятии мер по обеспечению иска (аресте денежных средств на счете и т.п.) до разрешения спора судом. В соответствии со ст.140 Гражданского процессуального кодекса РФ (ГПК РФ)
Мерами по обеспечению иска могут быть:
наложение ареста на имущество, принадлежащее ответчику и находящееся у него или других лиц
Применяются данные меры в том случае, если непринятие мер по обеспечению иска может затруднить или сделать невозможным исполнение решения суда (ст.139 ГПК РФ).
Рекомендую для выяснения всех обстоятельств дела обратиться письменно в банк за разъяснениями (на каком основании наложен арест на счет со ссылками на конкретный документ. А уже по реквизитам данного документа (номер дела в суде и т.п.) можно выяснить и все остальное.