Как происходит возмещение ущерба по результатам инвентаризации?

Доброй ночи, год назад работал в аптеке по трудовому договору и договор мат ответственности, была проведена инвентаризация общая сумма недостачи составила примерно 1000000₽, далее последовала кража денег из сейфа в которой обвинили меня, но так как никаких доказательств моей вины не было, и так же был организован опрос на полиграфе, мне предложили просто уволиться по собственному желанию, на что я согласился, так как морально было уже невыносимо там работать, по итогам инвентаризации я не подписывал никаких соглашений о возмещении ущерба так как антикражных ворот нет, ( а охранник был для мебели, он не следил за залом), спустя год на меня подали иск в суд. Как мне быть?