Вопрос - если поступить в ординатуру в этом году, будет ли отсрочка от призыва, учитывая то, что повестка есть на осенний призыв?

Сомнение еще в том, что в законах указано то, что отсрочку можно получить только один раз.

 Это не тот случай.

В законе действительно указано, что отсрочка предоставляется один раз.

Если буквально смотреть на данную норму, то в ней указано, что 

Предусмотренная настоящим подпунктом отсрочка от призыва на военную службу предоставляется гражданину только один раз

Выделенная оговорка имеет отношение к следующему подпункту п, 2 ст. 24 Закона

2. Право на отсрочку от призыва на военную службу имеют граждане:
а) обучающиеся по очной форме обучения в:
образовательных организациях по имеющим государственную аккредитацию образовательным программам среднего профессионального образования, — в период освоения указанных образовательных программ, но не свыше сроков получения среднего профессионального образования, установленных федеральными государственными образовательными стандартами;
образовательных организациях и научных организациях по имеющим государственную аккредитацию:
программам бакалавриата, если указанные обучающиеся не имеют диплома бакалавра, диплома специалиста или диплома магистра, — в период освоения указанных образовательных программ, но не свыше установленных федеральными государственными образовательными стандартами, образовательными стандартами сроков получения высшего образования по программам бакалавриата;
программам специалитета, если указанные обучающиеся не имеют диплома бакалавра, диплома специалиста или диплома магистра, — в период освоения указанных образовательных программ, но не свыше установленных федеральными государственными образовательными стандартами, образовательными стандартами сроков получения высшего образования по программам специалитета;
программам магистратуры, если указанные обучающиеся не имеют диплома специалиста или диплома магистра и поступили на обучение по программам магистратуры в год получения высшего образования по программам бакалавриата, — в период освоения указанных образовательных программ, но не свыше установленных федеральными государственными образовательными стандартами, образовательными стандартами сроков получения высшего образования по программам магистратуры.

Т.е. такая оговорка касается лиц обучающихся в средних специальных учебных заведениях, вузах, по программам бакалавриата, магистратуры, специалитета.

При поступлении в ординатура — отсрочка предоставляется на основании п.п. б п. 2 ст. 24 — и является самостоятельным основанием — что исключает к ней применение оговорки о том, что она предоставляется только один раз.

Кроме того, есть прецеденты (знакомые), когда им после поступления в ординатуру также приходили повестки и заставляли являться в военкомат. Насколько это законно?

 Выслать повестку в таком случае могут только для уточнения учетных данных.

Вызывать для проведения мероприятий связанных с призывом — незаконно.