Я директор ЧОПа, можно ли мне зарегистрироваться как самозанятый?

Денис, здравствуйте. 

Закон не ограничивает самозанятых в заключении трудовых договоров с работодателями. То есть вы, будучи директором организации можете работать и оказывать услуги как самозанятый.
Однако, есть другие ограничения, например, самозанятый не может оказывать услуги действующим или бывшим работодателям — компаниям или ИП, если с даты его увольнения прошло менее 2-х лет. Это прямой запрет (пп. 8 п. 2 ст. 6 Федерального закона от 27.11.2018 N 422-ФЗ) и т.д.
Есть также ограничения, непосредственно связанные с Вашим видом деятельности. Вы не сможете в качестве самозанятого  заниматься охранной деятельностью, поскольку  статьей 1  Закона РФ от 11.03.1992 N 2487-«О частной детективной и охранной деятельности в Российской Федерации» частная детективная и охранная деятельность определена как оказание на возмездной договорной основе услуг физическим и юридическим лицам имеющими специальное разрешение (лицензию), полученную в соответствии с настоящим Законом, организациями и индивидуальными предпринимателями в целях защиты законных прав и интересов своих клиентов.