Штрафы на оОо

Здравствуйте Никита.

ООО уже три года не работает (с сентября 2017 не какой деятельности не ведет. 

Как я понял, ООО не находится в процессе ликвидации или банкротства, а просто деятельность не ведётся. В таком случае ООО отвечает по своим обязательствам.  

В соответствии с ч. 1 ст. 3 Федерального закона от 08.02.1998 г. № 14-ФЗ «Об обществах с ограниченной ответственностью»

1. Общество несет ответственность по своим обязательствам всем принадлежащим ему имуществом

В данной ситуации Вы не можете обжаловать судебные приказы в кассационный суд общей юрисдикции без обоснования уважительности причины пропуска срока для обжалования. Этот срок составляет 6 месяцев (поскольку судебный приказ вступил в силу до 1 октября 2019 года). 

Поэтому наиболее приемлемый для вариант — взаимодействие с судебным приставом-исполнителем. Лучше всего полностью погасить задолженность (т.к. сумма задолженности небольшая). 
Судебный пристав-исполнитель может за неисполнение требований по исполнительным документам арестовать имущество, принадлежащее ООО (если сумма задолженности превышает 3000 рублей). Если сумма задолженности не превышает 3000 рублей, то возможен арест денежных средств (при открытии банковских счетов).

Кроме того, возможно взыскание исполнительского сбора в размере семи процентов от подлежащей взысканию суммы, но не менее 10 000 рублей.

Какие негативные последствия возможны для учредителя (единственный учредитель)?

Кроме того, долги ООО по налогам на имущество с каждым годом будут только увеличиваться. 

Если организация попадает под общий режим налогообложения и у неё на балансе учтено движимое или недвижимое имущество, то несмотря на то, что деятельность не ведётся ООО не освобождено ни от обязанности уплаты налога на имущество организаций, ни от представления налоговой отчетности по этому налогу. 

Пока нет банкротства, то учредитель (участник) ООО ответственности не несёт. А вот когда будет банкротство, то участники ООО привлекаются к субсидиарной ответственности по долгам ООО.